neprihlásený Sobota, 28. marca 2026, dnes má meniny Soňa
Sekvencovali genóm človeka pomocou čipového DNA sekvencéra

DSL.sk, 21.7.2011


Spoločnosť Ion Torrent Systems vyrábajúca inovatívne čipové DNA sekvencéry tento týždeň informovala o vytvorení kompletného genómu človeka pomocou svojej technológie.

Technológia Ion Torrent Systems na rozdiel od konkurenčných technológií nevyužíva detekovanie jednotlivých báz pomocou opticky detekovateľnej fluoreskujúcej látky naviazanej na komplementárnych bázach, základom jej technológie je polovodičový čip.

Na povrchu tohto čipu sa nachádza 1.2 milióna malých komôrok, do ktorých sa predpripravia rozličné segmenty jedného vlákna DNA dlhé 100 báz. Do komôrok sa postupne striedavo dávajú jednotlivé komplementárne bázy. Ak je vložená báza komplementárna k poslednej voľnej báze v analyzovanom vlákne, naviaže sa za súčasného vypustenia jadra vodíka spôsobujúceho zmenu pH. Senzor v každej komôrke detekuje túto prípadnú zmenu pH a tak postupne pri striedaní vkladaných báz detekuje poradie všetkých pôvodných báz.

Technológia mala v prvých verziách problémy s menšou presnosťou u dlhších sekvencií rovnakých báz, ktoré sa všetky naviažu v rovnakom cykle a detekovať ich je potrebné mierou zvýšenia pH. Podľa tvorcov v súčasnej verzii čipu ale už technológia dosahuje dostatočnú presnosť aj pri detekcii dlhších sekvencií rovnakej bázy.

Sekvencovanie DNA pomocou technológie Ion Torrent Systems zatiaľ nie je rovnako cenovo efektívne ako u najlepších technológií využívajúcich označovanie báz fluoreskujúcimi látkami, hoci investičné náklady do zariadenia pre sekvencovane sú nižšie, približne 49 tisíc dolárov oproti stovkám tisíc dolárov za zariadenia od Illumina a SOLiD.

Podľa tvorcov má ale technológia najväčší potenciál sa zlepšovať a môže dosiahnuť hranicu 1000 dolárov za sekvencovanie kompletného genómu osoby.

Na demonštráciu technológie, ktorá sa úspešne predáva od konca minulého roka a bola použitá napríklad na sekvencovanie DNA smrteľnej baktérie E-Coli objavujúcej sa na jar v Európe, spoločnosť Ion Torrent Systems sekvencovala DNA Gordona Moora, zakladateľa Intelu.

Čip Ion Torrent Systems sa jedným použitím znehodnotí. Celkové náklady na sekvencovanie DNA Moora dosiahli podľa odhadov až 2 milióny dolárov, použitá bola ešte ale staršia verzia čipu. Spoločnosť začala minulý týždeň predávať nový čip Ion 316, ktorý dokáže sekvencovať desaťnásobok oproti doterajšiemu čipu Ion 314, 100 miliónov báz za dve hodiny. Ešte tento rok plánuje začať predávať čip Ion 318 sekvencujúci 1 miliardu báz. Ľudská DNA pozostáva rádovo z troch miliárd báz.

V súčasnosti najefektívnejšie technológie umožňujú sekvencovať celý genóm osoby za rádovo 5 tisíc dolárov, ale pri výrazných investičných nákladoch. Kompletný genóm bol už vytvorený viacerým stovkám osôb.

Ion Torrent Systems plánuje dosiahnuť hranicu 1000 dolárov za vytvorenie kompletného genómu v roku 2013.



Najnovšie články:

V krátkom čase vydaná ďalšia aktualizácia OS pre routery OpenWrt 25.12
Odštartoval seriál o alternatívnom vývoji dobývania vesmíru
Ministerstvo vnútra má opäť IT problémy, ovplyvňujú klientské centrá
Mac Pro končí
Netflix opäť zdražuje, zatiaľ na domácom trhu
Google chce prejsť na kryptografiu odolnú kvantovým počítačom už do 2029
Predaje OLED monitorov sa takmer zdvojnásobili, viedol Asus
V CPU pre smartfóny vedie MediaTek, Qualcomm bol predbehnutý už aj Apple
Ministerstvo vnútra malo opäť IT problémy, ovplyvnili klientské centrá a oddelenia dokladov
Protimonopolný úrad urobil razie kvôli optickým sieťam


Diskusia:
                               
 

a viete co? uz ten genom len vytlacit vo veeeelkom kancli z maleho PDA cez BT, a prist si pre hotovy traktorovy papier..
Odpovedať Známka: -3.0 Hodnotiť:
 

- .-. .- .--. -. .
Odpovedať Známka: 6.7 Hodnotiť:
 

.-.
Odpovedať Známka: -5.0 Hodnotiť:
 

cez bitevny tank?
Odpovedať Známka: 5.8 Hodnotiť:
 

a prejde mi z obyvacky az na zahradu? :D
Odpovedať Známka: 10.0 Hodnotiť:
 

ion torrent? a ja som myslel, že robia nejakého p2p klienta :)
Odpovedať Známka: 10.0 Hodnotiť:
 

A nakoniec to skonci ako vo filme Gattaca...
Odpovedať Známka: 6.5 Hodnotiť:
 

skor Ostrov..
Odpovedať Známka: -5.0 Hodnotiť:
 

kazdy bude mat dve Scarletty? O.O
Odpovedať Známka: 8.2 Hodnotiť:
 

každý bude vyzerať ako Jude Law a jeho partnerka bude klon Scarlet Johanson prípadne Umy Thurman...
Odpovedať Známka: 6.4 Hodnotiť:
 

v Ostrove hral Mcgregor, Jude hral v Gataca. A ano, kazdy bude mat 2 Scarlety na 3ku :)
Odpovedať Známka: 9.0 Hodnotiť:
 

Jj ja viem Gataca hral Jude Law, Ethan Hawke a Uma bola jeho kunda a v Ostrove McGregor a Scarlett bola jeho kunda.
Odpovedať Známka: -1.4 Hodnotiť:
 

jo a Uma bola dobra len v Nebezpecnych znamostiach, potom uz vychudnuta skrata. Ale kua navnadil som sa na Scatlett, idem kuknut Girl with the pearl earing abo Lost in translation.
Odpovedať Známka: -3.3 Hodnotiť:
 

love song for bobby long je tiez fasa.
Odpovedať Známka: -6.0 Hodnotiť:
 

Girl with the pearl necklace? Aj tam hrala Scarleta?
Odpovedať Známka: -3.3 Hodnotiť:
 

http://www.csfd.cz/film/73862-divka-s-perlou/
Odpovedať Hodnotiť:
 

tak nic :)
Odpovedať Hodnotiť:
 

Prave variiii bez servitky!!!
Odpovedať Známka: 3.0 Hodnotiť:
 

kedy bude varit bez gatiek?
Odpovedať Známka: 7.0 Hodnotiť:
 

Ked si vymeni tie osrate za ciste.
Odpovedať Známka: 8.1 Hodnotiť:
 

...ked si ich vymeni, tak hadam bude mat ciste, takze nebude bez nich:-P

zaver: nemusi si nic menit, staci ked si aj tie osrate da dolu a ukaze nam svoju ka-dierku s cokoladovou prichutou so silou uraganu spinaveho lopeza:-P
Odpovedať Známka: 7.5 Hodnotiť:
 

Uz ti niekto povedal ze si riadne uchylny zmrd jebnuty na hlavu?
Odpovedať Známka: 2.0 Hodnotiť:
 

si mi to vybral s klavesnice ...akurat som sem chcel ist napisat ze janka dnes jebe mozgy v telke...neda sa ju pocuvat :D
Odpovedať Známka: 6.0 Hodnotiť:
 

na svete je viac takych veci co sa uz nedaju pocuvat, jednou z nich je napriklad omielanie tych istych fraz o janke hospodarovej co zacalo bohvie preco bohvie kde bohvie kvoli akemu banalnemu preslapu ktory sa stava kazdemu beznemu smrtelnikovi ale nesmie sa stat medialne znamej osobe lebo ak ano tak je z toho naramna zabava vsak? ano neviem co ma kto proti janke hospodarovej a je mi to celkom jedno, to ze neviem o kazdej kravine co sa kedy medialne znamym ludom stane este neznamena ze som "z Marsu", podla mna by sa mali nad sebou zamysliet skor ti co sleduju medialne zname osoby az tak horlivo ze vedia aj kedy sa idu s prepacenim vysrat... Tak a dajte mi minuska ak chcete, kolko minusok tolko zakomplexovanych janko-filov, avsak myslim ze poviem v mene vsetkych ktori su este pri zdravom rozume - dajte uz s tymi kokotinami o janke hospodarovej a podobnym omielackam svaty pokoj, dakujem, cest praci..
Odpovedať Známka: -1.0 Hodnotiť:
 

Kua ja som nepozeral TV asi dobre 3 tyzdne a ze nejake varenie alebo podobne picoviny ako spravy uz vobec nekukam
Odpovedať Známka: -5.4 Hodnotiť:
 

ty budes asi Janka Hospodarova, ked ta to tak trapi :-)
Odpovedať Známka: 3.5 Hodnotiť:
 

nie neni som janka hospodarova ani ina medialne nafukovana anca ale velmi by som ocenil aby ste s podobnymi picovinami nezasierali dsl.sk lebo je to uz maximalne trapne, je to uplne od veci, nikoho to nezaujima a kto sem chodi, urcite tu nehlada janku hospodarovu, a ak ty ano, tak to si o par zastavok mimo, vrat sa na fuckbook alebo pokec.sk
Odpovedať Známka: -3.8 Hodnotiť:
 

neviem ci mas pravdu s tym, ze kto sem chodi tu nehlada janku hospodarovu. Napis si do googlu "Janka Hospodarova" a hned druha ponuka je "janka hospodarova dsl" :-D
Odpovedať Známka: 0.7 Hodnotiť:
 

urcite tu nehlada janku h? tak skus napisat do googla "janka hosp" a pozri druhy navrhovany vyraz :-)
Odpovedať Známka: 0.0 Hodnotiť:
 

urcite tu nehlada janku h? tak skus napisat do googla "janka hosp" a pozri druhy navrhovany vyraz :-)
Odpovedať Známka: -0.8 Hodnotiť:
 

Najde teba.
Odpovedať Známka: 3.3 Hodnotiť:
 

presne tak, google najde akurat vsetkych tych trolov co sem chodia zasierat diskusie o j.h. ako nech sa na mna nikto nehneva ale vazne dajme tomu ze daco humorne sa o nej zomlelo ale ked sa to iste hovno zacne mlet furt dokola tak uz to nie je vtipne ale trapne, ano? aby sme si rozumeli, zrejme vam uz uplne jebe a neviete uz na com sa zasmiat. staci trochu chodit von do realneho sveta beznych smrtelnikov a garancia smiechu je zarucena, ak to nedokazete, potom ste na tom uz vazne zle ale omielat furt to iste hovno a este si mysliet ake je to vtipne, to ako neprospeje nikomu, nikto z normalnych ludi sa na tom ani nezasmeje ale ostane trapne ticho, presne take ako ked nejaky nestastnik povie nieco trapne a caka velky smiech a nikto sa nesmeje a on by sa v tej chvili najradsej v riti videl schovany.. pretoze v kutiku duse tusi ze prave v tej chvili vsetci ostatni citia uprimnu lutost nad jeho alarmujucou nekonecnou hlupostou.
Odpovedať Známka: -2.0 Hodnotiť:
 

Ja si o tebe zas myslim, ze si jeden z tych zakomplexovanych ludi, co na vsetko frflu, zo vsetkeho su podrazdeni a len hladaju na kom alebo na com sa vynervacit. Usmev urcite na tebe nikto nevidel cely zivot. Nikto tu nechce na nu nic zle hovorit alebo ju urazat. Janka Hospodarova je tu proste prdel, ale taky ako ty vydia vo vsetkom to najhorsie...
Odpovedať Známka: 2.9 Hodnotiť:
 

Tak to moment, ja mam rad humor a kazdy z realneho sveta to o mne vie, dokonca mi nevadi ani ta domrtva omielana tlac cez wifi vo velkom kancli a vies preco? pretoze to sa aspon tyka vypoctovej techniky kdezto j.h. tema nema s dsl.sk zhola nic spolocne akurat tak tych magorov co furt nevedia pochopit ze dsl.sk nie je bulvar a tak tu nemusia zasierat diskusie o j.h.. preco financne neprispeju do piana a nechodia diskutovat na nejake prijebane stranky kde su taki isti j.h. fetisisti ako oni? aha, vlastne so si sam odpovedal.. nato aby mohli zasierat tamojsie diskusie by museli platit a tu je to zadarmiko.. hmm.
Odpovedať Známka: 0.0 Hodnotiť:
 

Co uz ale spravis ked je niekto kto sa nemoze nikde inde vyjadrit a nic ine nevie napisat len o JH. Preto pride sem a zacne vypisovat a hned sa citi lepsie. Nic s tim nespravis...
Odpovedať Známka: 0.0 Hodnotiť:
 

Minusko ti davam len za to, ze nehovoris recou mojho kmena :P
Odpovedať Známka: 8.3 Hodnotiť:
 

nepochopil si retardón. vtipy o janke tu propaguje len zopar jedincov a tipujem ze uz 2 dni po vzniku tohto vtipu to neznasalo 99% ludi
Odpovedať Známka: 0.0 Hodnotiť:
 

Dali si dosť blbý názov firmy. Len aby im nezablokovali net. FUP je FUP
Odpovedať Známka: 6.0 Hodnotiť:
 

naco je dobre to sekvencovanie dna?
Odpovedať Známka: 0.0 Hodnotiť:
 

v buducnosti prides do nemocnice a povies. Chcem mat chlapca, chcem aby mal vlohy pre tenis, 1,95 vysoky, bez tych a tych a tych dedicnych chorob blablabla....bla, zoberu zene vajicko, tebe semeno a namiesaju ti co si si zaziadal. Nato. Resp mozno ani teba nebude treba, uz len zenu :)
Odpovedať Známka: 5.8 Hodnotiť:
 

a potom ti doktor povie "ja ju vytrtk*m, lebo mam presne tieto vlastnosti a usetrite 5000 dolarov"
Odpovedať Známka: 9.5 Hodnotiť:
 

A bude po zabave...
Odpovedať Známka: 7.5 Hodnotiť:
 

A budú len samí dokonalí ľudia? A kto bude potom robiť politiku?
Odpovedať Známka: 10.0 Hodnotiť:
 

..vzdy sa nejaky blbec najde...
Odpovedať Známka: 10.0 Hodnotiť:
 

"detekuje"
Odpovedať Známka: -6.7 Hodnotiť:
 

Sekvencovali => sekvenovali

Takto je to spravne
Odpovedať Známka: -4.5 Hodnotiť:
 

Vôbec sa mi nepáči, čo robia .. toto všetko sa tak ľahko môže zvrhnúť a zneužiť, že také veci by ani objavovať nemali ..
Odpovedať Známka: -3.3 Hodnotiť:
 

A cigani by nemali dostavat love a domy len tak pre nic za nic
Odpovedať Známka: 8.2 Hodnotiť:
 

co mas zas s ciganmi.. nestacilo ze vajda sa v jeden den rozculil v televizii a na druhy den ho jeblo? :D
Odpovedať Známka: 7.7 Hodnotiť:
 

tak to aby sa postupne všetci v telke rozčulovali.
Odpovedať Známka: 8.5 Hodnotiť:
 

ale keby ti zlyhali oblicky, a dalo by sa "vyrobit nove" ktore by boli totozne s tvojimi a teda by ich telo bez problemov prijalo a nemusel by si cakat kym sa dakto na motorke vybura, to by sa ti pacilo, co?
Odpovedať Známka: 8.6 Hodnotiť:
 

čo ti motorkár pomôže, tí už dávno nie sú darcami orgánov. vždy ich majú všetky potrhané.
Odpovedať Známka: 10.0 Hodnotiť:
 

Presne tak, pan vyssie to ma asi pomylene, to motorkari su vacsinou ti co tych darcov potrebuju ;-)
Odpovedať Známka: 10.0 Hodnotiť:
 

jj ako vcera ten cu*ak co nayebal bez prilby do stlpa v dedine. Este tam idu vyplakavat susedia aky on bol dobry chlapik. Taky bol blby, ze si neda prilbu na motorke a este kde ma ist max 50 isiel 300. Vodicaky by som tmy kktom bral, nieze ja idem 50 a vedla mna frrrrrrrrrrrng a uz je motorka o 200m predomnou lebo ide aspom 120.
Odpovedať Známka: 10.0 Hodnotiť:
 

No ak im zoberies vodicaky, odkial budes mat nahradny organ? Ved je to najlepsia zasobaren. podla mna by sme sa mali o nich lepsie starat.
- Samostatne okruhy s prudkymi zatackami, smyklavym povrchom obklopeny stromami
- Silnejsie motorky
- prikazat jazdit bez prilby
....spravit si vlastne take male farmy na nahradne organy
Odpovedať Známka: 10.0 Hodnotiť:
 

Z takychto tie nahradne organy tiez nebudu. Ked sa samovrah na motorke v 220km rychlosti poobjima so stromom, jeho vnutorne organy uz asi moc vnutorne nebudu. Nehovoriac o ich konzistencii. :/
Odpovedať Známka: 10.0 Hodnotiť:
 

Hmmm, tak treba vymysliet nieco bezpecnejsie (pre organy), aby sa aj koza nazrala a vlk ostal cely :)
Odpovedať Známka: 10.0 Hodnotiť:
 

takze nie v buducnosti, ale uz teraz...

http://goo.gl/Cx4OG
Odpovedať Hodnotiť:
 

Jeeeej babka to ste vy? Este stale chcete zrusit tie internety a vsetky tie protony?

Sorry ale tvoj nazor je ekvivalentny tejto virtualnej babke. Keby sme nebadali, stale sme s neandertalcami v jaskyniach. To ci nas to zabije alebo posilni a posunie je uz druha vec.
Odpovedať Známka: 5.6 Hodnotiť:
 

  ▲
Odpovedať Známka: -6.7 Hodnotiť:
 

Opat ste si to radovo neodpustili aj ked v tej vete nema co hladat... ludsky genom ma radovo 3 mld.... je to uz vtipne
Odpovedať Známka: 5.0 Hodnotiť:
 

suhlasim, take jednoduche slovo a oni nie a nie konecne pochopit jeho vyznam...
Odpovedať Hodnotiť:
 

Všetci ste tu múdri, a koľko je tu príspevkov k veci? Robíte si tu z toho chat, a nie diskusné fórum...a ak tu niekto napíše niečo normálne, tak po troch príspevkoch aj tak napíše niekto niečo také nenormálne, že mi idú oči vypadnúť. Ak nepíšete k veci, nepíšte radšej nič. Diskusia je o niečom inom.
Odpovedať Známka: -2.5 Hodnotiť:
 

omg, toto je DSL.sk, diskutovat mozes inde
Odpovedať Známka: 6.9 Hodnotiť:
 

Mas pravdu, toto je DSL.sk, nie pokec.sk, tak sa vrat skade si prisiel, ty omg.
Odpovedať Známka: -8.6 Hodnotiť:
 

co sem pleties porgc.sk? videl si na dsl.sk niekoho ponukat jedinecnu moznost ako si ho pozriet na webke cez skype pri sebaukajani?
Odpovedať Známka: 10.0 Hodnotiť:
 

Chlapi, vy ste slepi ?

Technológia Ion Torrent Systems

TITS

!!!
Odpovedať Známka: 9.4 Hodnotiť:
 

inak pekny clanok, niekto bud spolupracoval s biochemikom ci molekularnym biologom, alebo to niekto studoval z redaktorov, alebo sa niekto riadne naRRSkoval a nagooooooooglil
Odpovedať Známka: 10.0 Hodnotiť:
 

tak uz sa nehovori nasral ale naRRSkoval? :-)
Odpovedať Známka: 0.0 Hodnotiť:
 

moze mi prosim niekto vysvetlit naco je to dobre? nepytam sa ironicky, proste neviem preco niekto potrebuje poznat svoj genom
Odpovedať Známka: 10.0 Hodnotiť:
 

Lebo v ňom je ukrytá pravda :-)
Odpovedať Známka: 5.6 Hodnotiť:
 

aby si vedel, ktora cast DNA je zodpovedna za alzhaimera a ked tvoj syn bude este v stadiu zygoty (1 bunka po spynuti vajicka a spermie) tak to z tej DNA skrutkovice vyberu a uz alzheimera nedostane.
a na kopec kopec kopec dalsich veci. To je ako by si sa pytal naco je dobre vediet ako funguje vstrekovanie, ved motor ide, tak co?
Odpovedať Známka: 4.0 Hodnotiť:
 

dakujem ale myslel som naco clovek potrebuje vediet svoj genom, resp. naco to je x rocnemu cloveku (preco si dakto zaplati 5000 dolarov aby ho poznal)? teda osobne som tiez zvedavy na svoj ale ma to v tomto pripade aj nejake prakticke vyuzitie?
Odpovedať Známka: 10.0 Hodnotiť:
 

no ak niesi vedec, tak ti je poradie nukleotidov v DNA a este ktomu konkretne v tvojej na nic.
Odpovedať Hodnotiť:
 

a budu aj automaticke Bum-Headshot zbranove systemy v pripade, ze si v obchode pomylim oddelenie?
Odpovedať Známka: -5.0 Hodnotiť:
 

myslis napriklad ak namiesto na psychiatriu prides na geriatriu? :-)
Odpovedať Známka: 3.3 Hodnotiť:

Pridať komentár